Entre las actividades y proyectos de investigación del museo, especialistas de renombre internacional como Robert H. Wagner, dedicado al estudio de la evolución de la flora mundial; director del Museo Paleobotánico de Cordoba  y Cornelis  F. Winkler, del Nationaal Natuurhistorisch Museun de Leiden (Holanda); paleontólogo especializado en fauna marina del Paleozoico, visitaron los yacimientos donde  han sido descubiertos los restos de la flora más antigua de Gipuzkoa y de la Comunidad Autónoma Vasca y a otros, donde aparecen los fósiles de los primeros pobladores marinos de la C.A.V. Estos importantes hallazgos han sido realizados por Luberri a lo largo de los últimos años, en territorio del Parque Natural de Aiako Harria.

El equipo de investigadores visitó yacimientos del periodo Carbonífero, en Bera, Etxalar (Navarra) e Ibantelly (Lapurdi). Yacimientos paleontológicos enclavados en el denominado Macizo Paleozoico de Aiako Harria-Bortziriak. Formación geológica que dio origen a la formación de unas de las primeras tierras emergidas de Euskal Herria. En estos lugares se  explotaron, el siglo pasado, algunas minas de carbón de hulla. En ellas aparecen fósiles de la flora que colonizó las primeras tierras emergidas de nuestra geografía, en el Carbonífero (Estefaniense), hace 300 millones de años. Estas investigaciones han contribuido a ampliar el conocimiento sobre la flora continental y la  fauna marina litoral del Carbonífero (Namuriense- Estefaniense (360/300 m.a.).